遼寧水利職業學院有5個系，29個專科專業（含方向），各系專業如下：
（1）水利系：水利水電建筑工程、水利水電建筑工程（施工）、工程監理、工程造價、水利工程、城市水利；
（2）建筑與測繪工程系：建筑工程技術、測繪與地理信息技術、工程測量技術、市政工程技術、城鎮建設；
（3）生物工程系：飼料與動物營養、畜牧獸醫、食品加工技術、園藝技術、園林技術、園林技術（規劃設計）、水土保持、水文與水資源；
（4）管理系：物流管理、物業管理、農業經濟管理、會計電算化、項目管理；
（5）信息與電氣化系：計算機應用技術、機電設備維修與管理、供用電技術、通信技術、水電站動力設備與管理。